Okulumuz 1964 yılında Şerefiye İlkokulu adı altında inşa edilir. Ancak teslim edilmediği için bir yıl okulumuz öğrencileriyle buluşamaz. 1965–1966 eğitim-öğretim yılında teslim alınır ve adı da İrfan Baştuğ İlkokulu olarak değiştirilir ve 305 öğrenciyle 12 Ekim 1965 yılında eğitim-öğretime açılır. Yapıldığında 3 derslik olan okul, 1967-1968 öğretim yılının yaz döneminde ilave bir kat daha yapılarak 6 derslik, 1 müdür odası, 1 öğretmenler odası, 1 kütüphane ve diğer birkaç bölümleri tamamlanarak 1967-1968 yılında 560 öğrenci ile eğitime devam etmiştir. okulun bütün derslikleri 1969-1970 yılında kullanılmaya başlanmıştır.

50.Yıl Ortaokulu, 1972 yılında Merkez Ortaokulu adı altında öğretime ilimizde bulunan Ticaret Lisesi'nde 2 şube ve 60 öğrencisiyle başlamıştır. 1973 yılında bağımsız ortaokul olarak    Milli Eğitim Bakanlığı tarafından yaptırılan kendi binasında eğitim-öğretime devam etmiştir. Cumhuriyetin ellinci yılına denk geldiği için adı 50. Yıl Ortaokulu olarak değiştirilir. Bakanlığın emirleri doğrultusunda 1990 yılı Ekim ayında aynı bahçe içerisinde bulunan İrfan Baştuğ İlkokulu ile 50.Yıl Ortaokulu birleştirilerek okulun adı İrfan Baştuğ İlköğretim Okulu olarak değiştirilmiştir.

2011 yılındaki Van Depremi sonrasında hasar görmüş ve yıkımına karar verilmiştir. Öğrencilerimiz 2011-2012 eğitim-öğretim yılını okulun bahçesinde kurulan çadırlarda eğitim-öğretimini tamamlamak zorunda kalmıştır. 

Yıkılan okulumuzun yerine Hayırsever İşadamlarımızdan Zafer YILDIRIM ve Zafer KURŞUN, (Ortak Gayrimenkul Yatırım ve Yönetim Turizm A.Ş.) tarafından Nisan 2012 tarihinde yapımına başlanmış ve 24 Eylül 2012 tarihinde bütün birimleriyle birkilte tamamlanmış halde 32 derslik ve 1817 öğrencisiyle  eğitim-öğretime başlamıştır. (Okulumuz aynı tarihte ev sahibi olarak İnönü İlköğretim okuluna da kapısını açmıştır.) Yapılan yeni okulumuzun adı Van Valiliği ile yapılan protokol gereği okulu yapan Hayırsever işadamlarımız Zafer YILDIRIM ve Zafer KURŞUN Beylerin adlarını verilmek üzere 21 Eylül 2012 tarihinde  ZAFERLER İLKOKULU-ZAFERLER ORTAOKULU- ZAFERLER İMAM HATİP ORTAOKULU olarak değiştirilmiştir